依據《中國食品安全發展報告(2016)》（以下簡稱報告）指稱臺灣是大陸進口不合格食品的第一大來源地。其中，2014年大陸進口不合格食品批次最多的來源地是臺灣(773批次，占22.06%)；2015年大陸進口不合格食品批次最多的來源地也是臺灣(730批次、占26.02%)。2014年和2015年大陸從臺灣進口的不合格食品批次，約占這兩年大陸進口所有不合格食品批次的四分之一。
報告分析認為，目前食品安全主要風險在5個方面：
1. 非法添加非食用物質與不規範使用食品添加劑;
2. 微生物指標超標，主要是部分樣品菌落總數、大腸菌群和黴菌等指標超標;
3. 鋁、鉛、鎘等重金屬指標超標;
4. 農獸藥殘留超標，主要是檢出克百威、氯黴素、孔雀石綠、瘦肉精等禁限用農獸藥;
5. 品質不達標，涉及肉及肉製品、水產品及其製品、調味品等酸價超標，葡萄酒及果酒的酒精度不達標，飲用純淨水電導率不合格等。
自臺灣進口食品檢驗不合格，主要有以下因素：
1. 標簽不合格或不符合規定；
2014年，某台灣製點心麵因標簽不合格被銷毀。據上海城市超市有限公司表示，台灣食品標籤標示經常不符合大陸的規定，比如食品不可以強調有保健功能，所以該公司在銷售前都要貼掉不合規的字眼。
2. 兩岸食品添加劑標準不同；
上海某高端超市王姓主管表示，兩岸在食品添加劑上的標準真的差很多，有些在臺灣可以添加的東西，在大陸是禁止的以至會影響進口。
3. 使用非法添加非食用物質與食品添加劑；
據中國進口食品網消息，2014年底杭州檢驗檢疫局銷毀7批不合格食品。主要產品為麵包幹、飲料、餅乾和膨化食品，原產地為越南、韓國和臺灣。其中包括首次進口的某臺灣製甜甜圈，甜甜圈是檢出有硼砂和鋁兩種禁止使用的添加劑。2015年國家質檢總局曾多次發佈臺灣食品警示通報，如某臺灣製糖果違規使用甜味劑、某臺灣製豆漿被檢出轉基因成分的質檢資訊、某臺灣製海苔脆片因檢出硼砂被銷毀、某臺灣製竹炭花生因違規使用竹炭黑色素被銷毀。
4. 微生物指標超標；
主要是部分樣品菌落總數、大腸菌群和黴菌指標超標。從大陸質檢總局獲悉，2014年11月有10批某臺灣製燕麥片因水分超標被退貨。2014年10月、9月進境不合格食品資訊中，某臺灣製燕麥片也榜上有名，分別有5批和2批產品因水分超標。某臺灣製鳳梨酥（散稱）（熱加工糕點）菌落總數超標。2015年臺灣某公司已被攔截檢出30批次不合格，其生產的螺旋藻藍蛋白粉、膠原紅海藻粉、某某牌菠蘿酵素固體飲料、某某牌紅海藻味固體飲料等多款產品，存在水分超標、菌落總數超標、品質不合格等。
參考資料
1、 中國江南大學、曲阜師範大學和《中國食品安全報》於2016年12月6日在北京聯合發佈的《中國食品安全發展報告(2016)》
2、 臺灣不合格食品位居第二——《2015年上半年進口食品質量安全狀況》
3、 不合格進口食品之最——《中國質量新聞網》
4、 臺灣是大陸進口不合格食品的第一大來源地——《搜狐新聞》
